发现号抵达与联邦的重生

为了躲避“控制”的威胁，USS发现号从2258年跃入了九百多年后的未来。身穿红天使服、开辟道路的迈克尔·伯纳姆于3188年率先抵达；飞船则在一年后的3189年出现。他们发现，这个银河系饱受大燃烧的摧残，星际联邦只剩下一个分散而隐蔽的残余。

在信使克利夫兰·布克的帮助下，船员们找到了联邦总部及其指挥官查尔斯·万斯将军。发现号换装了32世纪的技术，而它那无需二锂的孢子驱动器使它成为舰队中最宝贵的舰船之一。它的船员帮助解开了大燃烧之谜，并与昔日的成员世界重建了互信。

翡翠链夺取联邦总部后，船员们将其夺回，击败了这个犯罪集团。伯纳姆成为发现号的舰长，随着二锂供应和曲速航行的恢复，一个重建的新时代就此开启。