Fin de la guerre du Dominion et traité de Bajor

En 2375, le Dominion, renforcé par son alliance avec les Breens, tient toujours Cardassia, mais ses sujets cardassiens se retournent contre lui. Un mouvement de résistance mené par Damar, avec l'aide de Kira Nerys et d'Elim Garak, sabote les installations du Dominion dans tout l'espace cardassien. En représailles, les Fondateurs ordonnent la destruction de villes cardassiennes entières.

Les flottes fédérale, klingonne et romulienne lancent une offensive finale jusqu'à Cardassia Prime, aidées par les vaisseaux cardassiens qui changent de camp en pleine bataille. Alors que les Jem'Hadar entreprennent d'exterminer la population, Odo rejoint la Fondatrice, se lie à elle et la guérit de la maladie morphogénique qui décime les Fondateurs. Elle ordonne à toutes les forces du Dominion de cesser le combat.

La guerre s'achève officiellement par le traité de Bajor, et la dirigeante des Fondateurs accepte d'être jugée. Le bilan est terrible : Cardassia est en ruines et quelque 800 millions de Cardassiens ont péri. Odo rejoint le Grand Lien pour transmettre le remède aux siens.