La crise V'Ger

Vers 2273, un immense nuage d'énergie pénètre dans l'espace de la Fédération, détruisant sur son passage trois croiseurs klingons et la station d'observation Epsilon IX. Il se dirige droit vers la Terre. Le seul vaisseau à portée est l'Enterprise, qui sort tout juste d'une longue refonte. L'amiral James T. Kirk en reprend le commandement au capitaine Willard Decker, qui reste à bord comme second, et Spock rejoint l'équipage après avoir renoncé à la discipline vulcaine du Kolinahr.

Au cœur du nuage se trouve une gigantesque machine vivante qui se nomme V'Ger. Elle enlève la navigatrice Ilia et renvoie une sonde à son image pour étudier l'équipage. V'Ger cherche son créateur et, jugeant indigne la vie terrestre à base de carbone, s'apprête à la détruire. L'équipage découvre que son noyau est Voyager 6, une sonde de la NASA du XXe siècle perdue puis reconstruite par une race de machines en une entité colossale et consciente.

V'Ger veut s'unir à son créateur pour poursuivre son évolution. Decker se porte volontaire pour fusionner avec elle et la sonde Ilia, et tous disparaissent dans une nouvelle forme d'existence. La Terre est sauvée, et la crise marque le retour de Kirk et de son équipage à bord de l'Enterprise refondu.