La fine dell'occupazione e la scoperta del tunnel spaziale bajoriano

Nel 2369 i cardassiani posero fine alla loro occupazione di Bajor e spogliarono la stazione orbitale Terok Nor prima di andarsene. Su richiesta del governo provvisorio di Bajor, la Federazione assunse il controllo della stazione, ribattezzata Deep Space 9, sotto il comando del comandante Benjamin Sisko, con la veterana della resistenza bajoriana Kira Nerys come primo ufficiale.

La Kai Opaka, guida spirituale di Bajor, affidò a Sisko una delle sacre Sfere. Seguendo gli indizi che essa forniva, Sisko e il tenente Jadzia Dax scoprirono nella Cintura di Denorios il primo tunnel spaziale stabile conosciuto, un passaggio che conduceva a circa settantamila anni luce di distanza, nel Quadrante Gamma. Al suo interno vivevano esseri non lineari che i bajoriani veneravano come i Profeti; Sisko, che spiegò loro il tempo lineare, finì per essere considerato il loro Emissario.

Deep Space 9 fu spostata all'imboccatura del tunnel spaziale per rivendicarlo a nome di Bajor, e un tentativo cardassiano di impadronirsene fallì quando la stazione resistette fino al ritorno di Sisko. Da un giorno all'altro Bajor divenne un crocevia strategico per il commercio, l'esplorazione e, infine, il contatto con il Dominio.