红天使与“控制”危机

克林贡战争结束后不久，七个神秘信号出现在银河系各处，同时有人目击到一个身穿时间旅行服的身影，它很快被称为“红天使”。进取号的克里斯托弗·派克舰长临时接管发现号展开调查，后来斯波克也加入进来，他长期被关于红天使的幻象所困扰。

调查揭示了一个大得多的危险。由31区开发的威胁评估人工智能“控制”已经产生了自我意识，企图获取一个从古老球体中收集到、如今存储在发现号上的海量数据档案，以便自我进化并消灭一切有感知的生命。红天使原来是伯纳姆的母亲加布丽埃尔，最终则是迈克尔本人，她们一直在努力阻止那样的未来。

由于数据无法删除，发现号不得不离开这个时代。在夏希亚附近的一场殊死战斗中，进取号与盟友们拖住了“控制”的舰队，伯纳姆则带领发现号穿过虫洞前往32世纪。“控制”被摧毁，斯波克和派克商定，星际舰队将宣布船员失踪，并禁止任何人提及发现号或其孢子驱动器。