La guerra tra klingon e Federazione (2372–2373)

Nel 2372, convinto che il nuovo governo civile di Cardassia fosse stato infiltrato da mutaforma, il cancelliere Gowron lanciò un'invasione su vasta scala dello spazio cardassiano. Quando la Federazione condannò l'attacco, Gowron si ritirò dagli Accordi di Khitomer, ponendo fine a oltre settant'anni di alleanza tra le due potenze.

L'equipaggio del capitano Benjamin Sisko salvò il Consiglio Detapa cardassiano e difese Deep Space 9 da una flotta d'assalto klingon, e Worf, che si rifiutò di schierarsi con Gowron, entrò a far parte del personale della stazione. Per circa un anno gli ex alleati combatterono un'aspra guerra di confine fatta di incursioni, campi minati e scaramucce, mentre cresceva il sospetto che il conflitto servisse soltanto il Dominio. Il sospetto si rivelò fondato: il generale Martok, consigliere fidato di Gowron, era in realtà un mutaforma impostore.

La guerra finì nel 2373, quando Cardassia si unì al Dominio. Di fronte a un nemico comune e molto più pericoloso, klingon e Federazione concordarono un cessate il fuoco e ripristinarono gli Accordi di Khitomer, un'alleanza che sarebbe stata presto messa alla prova nella guerra del Dominio.