La Voyager varada en el cuadrante Delta

En 2371, el nuevo USS Voyager, al mando de la capitana Kathryn Janeway, entró en las Badlands en persecución de una nave maquis dirigida por Chakotay, en la que su oficial de seguridad, Tuvok, servía de incógnito. Ambas naves fueron atrapadas por una potente onda de desplazamiento y trasladadas unos setenta mil años luz, hasta el cuadrante Delta. El tránsito causó la muerte de varios oficiales superiores de la Voyager, entre ellos su primer oficial y su jefe médico.

La onda era obra del Protector, un alienígena moribundo que llevaba mucho tiempo protegiendo a los ocampa y buscaba una especie compatible para perpetuar su linaje. Tras su muerte, su estación podría haber enviado a la Voyager a casa, pero también podía caer en manos de los hostiles kazon y poner en peligro a los ocampa. Janeway decidió destruirla, dejando a su nave varada a unos setenta y cinco años de viaje del espacio de la Federación.

La nave maquis se perdió cubriendo la huida de la Voyager, y su tripulación se unió a la de la Flota Estelar, con Chakotay como primer oficial. Con la incorporación del guía talaxiano Neelix y de la ocampa Kes, la tripulación unificada emprendió el largo viaje de regreso a casa.